Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L4A6NEF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms