Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms