Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C5orf49A4QMS7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C5orf49A4QMS7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms