Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRD1A4D1F6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRD1A4D1F6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms