Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms