Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F8A0AVK6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms