Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms