Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC233724.17-201ENST00000639073 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC106774.8-201ENST00000639081 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HENMT1-201ENST00000370031 1717 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SERPINB2-205ENST00000457692 2155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NUTM1-202ENST00000438749 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 KCNT2-201ENST00000294725 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CU634019.1-201ENST00000623095 2247 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CU633904.1-202ENST00000625096 2247 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DENND2A-208ENST00000492720 3614 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 YWHAQP5-201ENST00000415616 1382 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RUFY3-204ENST00000502653 2342 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CD33-204ENST00000436584 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CAMK2D-208ENST00000508738 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FAM69A-203ENST00000613902 2468 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SELE-202ENST00000367774 1518 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CFAP161-201ENST00000286732 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL138690.1-201ENST00000568811 2243 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL023755.1-202ENST00000636459 1665 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CASK-208ENST00000442742 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MAPK10-382ENST00000642023 2369 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF750-201ENST00000269394 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 APH1B-203ENST00000380343 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IGLV3-19-201ENST00000390309 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC02271-201ENST00000398777 546 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL355297.1-201ENST00000402808 388 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC245036.3-201ENST00000429259 146 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC114737.1-201ENST00000434531 453 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC02020-204ENST00000435548 604 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC093627.5-201ENST00000462565 662 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PFN1P9-201ENST00000475753 433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC005522.2-201ENST00000479299 453 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL169P-201ENST00000485643 289 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NDUFB4-205ENST00000492739 309 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OR7E43P-201ENST00000503910 920 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GAPDHP60-201ENST00000513846 995 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HCCAT5-201ENST00000569990 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC005154.4-201ENST00000579437 427 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GDPD1-206ENST00000581276 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL44P-201ENST00000583849 302 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC027575.4-201ENST00000622010 586 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TTLL6-202ENST00000393382 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PARL-212ENST00000639100 1513 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 KCNE1-206ENST00000432085 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC108215.1-201ENST00000624463 3226 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ERICH6-203ENST00000491361 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FAM98B-203ENST00000491535 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GSTM2-203ENST00000369829 914 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IGLC2-201ENST00000390323 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IGLC3-201ENST00000390325 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TRAV2-201ENST00000390424 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GAPDHP63-201ENST00000405405 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SKP68-201ENST00000411055 307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC021028.1-201ENST00000417559 598 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IGLVIVOR22-2-201ENST00000430579 330 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC084851.3-201ENST00000432771 573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL031674.1-203ENST00000448013 538 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL567P-201ENST00000462015 303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC079340.2-202ENST00000504785 448 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC097518.1-201ENST00000512516 421 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FCF1-202ENST00000534938 794 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC025576.2-201ENST00000535806 390 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL359792.1-201ENST00000554046 385 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC00566-201ENST00000561557 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC011899.3-201ENST00000608596 617 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC244472.3-201ENST00000611520 428 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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