Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNPO3Q9Y5L0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms