Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB12Q9Y5F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms