Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1DQ9Y2S0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms