Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms