Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1024Q9UPX6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms