Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX7Q9UNH6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms