Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNRF3Q9ULT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNRF3Q9ULT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms