Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SWAP70Q9UH65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms