Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPG2Q9UBF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPG2Q9UBF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms