Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHPF2Q9P2E5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHPF2Q9P2E5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms