Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms