Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK12Q9NYV4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms