Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms