Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM53CQ9NYF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM53CQ9NYF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms