Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VNN3Q9NY84 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms