Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D2Q9NY47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms