Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms