Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBNL3Q9NUK0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms