Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms