Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDS5BQ9NTI5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.8 ms