Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCND1Q9NSA2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms