Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 525.18■■□□□ 1.621e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 525■■□□□ 1.591e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.451e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.421e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 523.38■■□□□ 1.331e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)23.01■■□□□ 1.271e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 221.89■■□□□ 1.091e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 521.2■□□□□ 0.981e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 420.62■□□□□ 0.891e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-222ENST00000513800 949 ntTSL 238.51■■■■□ 3.762e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 238.51■■■■□ 3.762e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 438.51■■■■□ 3.762e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-205ENST00000502930 548 ntTSL 437.43■■■■□ 3.582e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 235.11■■■■□ 3.212e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-215ENST00000509068 805 ntTSL 334.22■■■■□ 3.072e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-206ENST00000504113 594 ntTSL 433.98■■■■□ 3.032e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 229.43■■■□□ 2.32e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 27.7□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.722e-6■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.572e-6■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 MMP17-210ENST00000545671 775 ntTSL 338.03■■■■□ 3.684e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 MMP17-211ENST00000545790 552 ntTSL 235.82■■■■□ 3.324e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.544e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.44e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 DPP7-208ENST00000478597 943 ntTSL 338.76■■■■□ 3.84e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 DPP7-212ENST00000491807 618 ntTSL 332.19■■■□□ 2.744e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 DPP7-207ENST00000473703 684 ntTSL 327.45■■□□□ 1.984e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 DPP7-213ENST00000497375 817 ntTSL 526.6■■□□□ 1.854e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.069e-7■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.219e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-218ENST00000482282 1029 ntTSL 522■■□□□ 1.119e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.559e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.29e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.199e-11■■■■□ 21.1
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-210ENST00000482839 852 ntTSL 223.63■■□□□ 1.374e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 28.21□□□□□ -1.13e-13■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-13■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 24.16□□□□□ -1.743e-13■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 341.07■■■■■ 4.162e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.462e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 336.06■■■■□ 3.362e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.972e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 433.39■■■□□ 2.942e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 533.39■■■□□ 2.942e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 333■■■□□ 2.872e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 532■■■□□ 2.712e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.442e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 329.32■■■□□ 2.282e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 229.32■■■□□ 2.282e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 329.29■■■□□ 2.282e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.142e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.92e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 424.83■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 524.36■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 PURA-203ENST00000505703 597 ntTSL 340.92■■■■■ 4.147e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 PURA-202ENST00000502351 502 ntTSL 240.75■■■■■ 4.117e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-210ENST00000497674 563 ntTSL 227.71■■■□□ 2.037e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 527.71■■■□□ 2.037e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 427.5■■□□□ 1.997e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-203ENST00000444801 568 ntTSL 325.96■■□□□ 1.757e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 TACC3-207ENST00000470808 947 ntTSL 223.59■■□□□ 1.377e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.347e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 221.96■■□□□ 1.117e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.966e-6■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-209ENST00000493692 951 ntTSL 520.9■□□□□ 0.947e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.777e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 TACC3-202ENST00000404054 2771 nt19.26■□□□□ 0.677e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.086e-6■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.197e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 513.76□□□□□ -0.217e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.287e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 GORASP2-206ENST00000471559 812 ntTSL 412.85□□□□□ -0.357e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.617e-11■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 521.89■■□□□ 1.13e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 DDX17-209ENST00000479734 441 ntTSL 424.01■■□□□ 1.439e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.66■■□□□ 1.389e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.619e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 216.27■□□□□ 0.199e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.069e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.256e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 332.11■■■□□ 2.736e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.196e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.486e-9■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.565e-8■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 342.32■■■■■ 4.371e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.31e-7■■■■□ 21
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