Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUOX1Q9NRD9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms