Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms