Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms