Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 515.7 ms