Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB18Q9NP72 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB18Q9NP72 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms