Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP29Q9HBJ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP29Q9HBJ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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