Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SENP3Q9H4L4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SENP3Q9H4L4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms