Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRABDQ9H4I3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRABDQ9H4I3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms