Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms