Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MIXL1Q9H2W2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms