Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM60Q9H2L4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM60Q9H2L4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms