Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP4Q9C0A0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP4Q9C0A0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms