Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms