Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM6Q9C030 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms