Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms