Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPO3Q9BXY4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSPO3Q9BXY4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms