Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRTQ9BXP5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms