Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms