Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLVAPQ9BX97 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms