Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL6Q9BWW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL6Q9BWW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms